La Unidad de Diagnóstico Molecular y Celular (UDMC) constituye un servicio de referencia para el análisis molecular y celular de muestras de personas con sospecha o diagnóstico establecido de padecer cáncer. Una de sus características más importantes es la posibilidad de realizar un diagnóstico preciso y rápido, en el que se integren los resultados de inmunofenotipo, citogenética y análisis molecular.
La unidad pretende además aplicar con fines diagnósticos técnicas novedosas que requieren una infraestructura compleja para trasladar al área clínica los avances científicos alcanzados por los equipos investigadores más básicos Entre estas tecnológicas se incluyen técnicas genómicas y proteómicas o métodos de separación de células que permiten la identificación y separación de células presentes en una muestra a muy baja frecuencia, de forma más rápida y precisa que con el uso de las técnicas actuales.
Entre los objetivos están:
- Proporcionar un diagnóstico preciso y novedoso a las unidades hospitalarias de Oncología, Hematología y Anatomía Patológica que permitan seleccionar el tratamiento más adecuado a cada paciente.
- Analizar las características fenotípicas/genéticas/moleculares de las células tumorales con valor clínico-pronóstico que permitan estratificar los pacientes en grupos de riesgo diferente, así como seleccionar terapias específicas (Ej. identificar dianas tumorales frente a las que se disponga de fármacos específicos).
- Monitorización terapéutica de los pacientes y detección de enfermedad mínima residual mediante técnicas inmnofenotípicas y moleculares.
- Análisis del sistema inmune de pacientes con neoplasias sólidas y hematológicas mediante estudio de la distribución de poblaciones celulares y estudios funcionales relacionados con la respuesta inmune: producción de citocinas (intracelulares y solubles).
Estudio de polimorfismos genéticos del paciente (incluido tipaje HLA) con aplicaciones clínico-biológicas y terapéuticas, (Ej.: Selección de donante más adecuado, identificar pacientes con diferente respuesta/toxicidad a determinados fármacos, con diferente riesgo de segundas neoplasias, etc...).
Cartera de servicios
Las pruebas y metodologías de las que se disponen las podemos agrupar en las tres áreas que constituyen la Unidad de Diagnóstico Molecular y Celular.
Área de INMUNOFENOTIPADO
- Caracterización inmunofenotípica de células tumorales en suspensión de diferentes tejidos (médula ósea, sangre periférica, fluidos biológicos, adenopatías, piezas tumorales etc...) de neoplasias sólidas y hematológicas, mediante citometría de flujo multiparamétrica (x 4-8 colores).
- Marcajes simultáneos de antipuerpos monoclonales con colorantes de DNA para el estudio del contenido de ADN y ciclo celular de las células tumorales.
- Diagnóstico y clasificación de otras enfermedades hematológicas de naturaleza clonal (Ej hemoglobinuria paroxística nocturna y mastocitosis sistémicas).
- Detección y monitorización de enfermedad mínima y/o residual (EMR) en tumores sólidos y hematológicos mediante citometría de flujo multiparamétrica.
- Detección de anticuerpos frente a plaquetas, y análisis de activación plaquetaria.
- Separación de poblaciones celulares tumorales.
- Cuantificación de progenitores hematopoyéticos y recuento de leucocitos residuales en bolsas de transfusión o terapia celular.
- Análisis fenotípico y funcional del sistema inmune en neoplasias.
Área de CITOGENÉTICA ONCOLÓGICA
- Estudios de Cariotipo convencional de las células tumorales en suspensión de neoplasias sólidas y hematológicas de diferente origen: médula ósea, sangre periférica, adenopatías etc.
- Estudio de hibridación “in situ” (centromérica, pintado, traslocaciones, delecciones) de células tumorales de diferente origen: células frescas y cultivadas de MO y SP, muestras en parafina etc.
- Estudio de hibridación genómica comparada de muestras tumorales
- Estudio mediante microarrays genómicos, microarrays de expresión, en muestras tumorales, normales o de subpoblaciones celulares separadas. Microarrays de farmacogenética.
Área de BIOLOGÍA MOLECULAR
- Estudio de clonalidad linfoide B y T tanto al diagnóstico como para EMR en células frescas y muestras en parafina.
- Estudio de traslocaciones cromosómicas mediante técnicas de PCR (PCR cualitativa o cuantitativa en tiempo real, RT-PCR para diagnostico y EMR.
- Estudio de mutaciones somáticas en células tumorales útiles para identificar dianas terapéuticas y/o con valor pronóstico y/o como marcador de EMR.
- Estudio de expresión génica mediante técnicas de RT-PCR de genes con valor diagnóstico y pronóstico y como marcador de EMR.
- Estudios de polimorfismos genéticos mediante estudio arrays o ensayo individual útiles para identificar pacientes con diferente sensibilidad/resistencia a fármacos, mayor susceptibilidad a segunda neoplasias etc.
- Tipaje HLA de baja y alta resolución (para selección de donantes de órganos y riesgo enfermedad injerto contra huésped)
Estudio de quimerismo mediante estudio de regiones microsatélitites tipo STR.
Equipamiento y localización
Este servicio se encuentra localizado en el Servicio de Hematología, y en la planta sótano de la Facultad de Medicina. La descripción del equipamiento y del personal se hará de forma individual en cada una de las tres áreas que constituyen la UDMC.
Área de INMUNOFENOTIPADO
- 1 citómetro de flujo separador (modelo FACSAria de Becton/Dickinson Biosciences).
- 6 citómetros analizadores (1 FACSort, 2 FACScalibur, 2 FACSCanto II de Becton/Dickinson Biosciences y un Cyan de Dakocytomation).
- 2 sistemas de citometría estática (1 Citómetro de escaneo por laser LSC de Compucyte/Olympus y 1 Sistema de análisis de imagen con microscopia de fluorescencia DISCOVERY de Becton/Dickinson Biosciences).
- Un separador magnético automatizado (AutoMACS, Myltenyi Biotec).
- Resto de equipamiento necesarios para un laboratorio de citometría / separación celular (centrífugas, citocentrífuga, sistema de preparación de suspensiones unicelulares (CYTYK), sistema de disgregación automática de tejidos sólidos, etc.).
Área de CITOGENÉTICA ONCOLÓGICA
- Cuatro microscopios de fluorescencia y de luz brillante acoplados a sistemas de cariotipado.
- Un microscopio de fluorescencia con platina motorizada y sistema de carga de preparaciones automatizado.
- Sistemas de cariotipado automático Cytovision y Metasystems.
- Espectrómetro tipo "nano-drop" para la cuantificación de ácidos nucleicos.
- Sistema de hibridación de Nimblegene (horno y estación de hibridación).
- Dos equipos de separación celular por anticuerpos monoclonales (Miltenyi).
- Ordenadores software de análisis.
- Resto de equipamiento de un laboratorio de citogenética molecular (cámaras de flujo laminar, estufas de cultivo con CO2, citocentrífugas y baños de agitación a temperatura variable, termocicladores.
Área de BIOLOGÍA MOLECULAR
- Cuatro equipos de PCR cuantitativa a tiempo real: Un 7900HT, dos StepOnePlus (Applied Biosystems) y un LightCycler (Roche Diagnostics).
- Dos secuenciadores automáticos: Un 3130 y un 3500 XL (Applied Biosystems).
- Un fluoroanalizador (Luminex).
- Dos extractores automáticos de Ac Nucleicos: MagnaPure y Maxwell.
- Resto de equipamiento (8 termocicladores, microfugas, centrígufas de tubos y placas etc.) necesarios para un Laboratorio de Biología Molecular.