El Área de Enfermedades Infecciosas, Inflamatorias y Metabólicas está formada por 19 grupos de investigación de los cuales 10 son consolidados, 5 son emergentes y 4 son clínicos asociados. El coordinador de área es el Dr. Jose Juan García Marín y Dr. Ignacio Jesús Dávila González.
- IIMD-01 Alergología
- IIMD-02 Alcohol y sistema inmune
- IIMD-03 Enfermedades óseas e inflamatorias musculo esqueléticas
- IIMD-04 Dermatopatología tumoral e inflamatoria
- IIMD-05 Factores de crecimiento en anatomía patológica
- IIMD-06 Estrés oxidativo y proteínas transportadoras en la fisiopatología hepática
- IIMD-07 Medicina molecular
- IIMD-08 Hepatología experimental y vectorización de fármacos (HEVEFARM)
- IIMD-09 Enfermedades infecciosas y tropicales (E-INTRO)
- IIMD-12 Neuroendocrinología y obesidad
- IIMD-13 GISAD Grupo de investigación salmantino en aparato digestivo
- IIMD-14 Neuroenergética y Metabolismo
- IIMD-15 Bioquímica clínica
- IIMD-16 Microbiología y parasitología clínicas y antimicrobianos
- IIMD-17 Patología musculoesquelética
- IIMD-18 Autofagia, inmunidad innata e inflamación
- IIMD-19 Grupo de Investigación de Reproducción Humana
- IIMD-20 Pediatría Clínica
- IIMD-21 Proteómica Funcional y Nanomedicina