La Unidad de Bioinformática, con apoyo y asesoramiento del Grupo de Investigación en Bioinformática y Genómica Funcional (grupo IBSAL Javier De las Rivas), ofrece servicios de análisis computacional y bioinformático de datos biomoleculares complejos, con especial capacidad en análisis de datos transcriptómicos derivados de microarrays de expresión genómica. Así mismo, se dispone de un grupo nuevo de bioestadística de reciente incorporación en el IBSAL que presta el apoyo necesario a la investigación clínica del Hospital.
Cartera de servicios
- Análisis de datos de microarrays de expresión (principalmente para arrays de Affymetrix).
- Análisis múltiple comparativo de varios estados.
- Análisis de perfiles de expresión de genes específicos.
- Análisis a medida.
- Análisis funcional mediante el uso de bases de datos de genomas, diversas herramientas de anotación genómica y proteómica, bases de datos de microarrays de expresión génica en diferentes tejidos.
- Herramientas para análisis de datos de expresión y de anotación y análisis funcional: APID (Agile protein interaction dataAnalizer), APID2NET (cytoscape plugin for APID), GATE (Genomic and Transcriptomic Explorer), mapCGHetExpression, MicroarrayDB, webbioc.
- Análisis de estadística descriptiva, estudios uni y multivariantes, correlación, componentes principales, análisis de supervivencia, etc.
Equipamiento y localización
Este servicio se encuentra localizado en el laboratorio 19 del IBMCC y en el HUS. La infraestructura de que dispone cuenta con:
- Ordenadores de sobremesa y portátiles.
- Programas informáticos apropiados y acceso a internet.
- Impresoras.